RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPA1	O75762	1119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	GNAI2	P04899	355 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	GRIK5	Q16478	980 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	AOX1	Q06278	1338 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TNNI2	P48788	182 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	MTX1	Q13505	466 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	MAST3	O60307	1309 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TM4SF4	P48230	202 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM10	P62072	90 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	SEMA3E	O15041	775 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	TFCP2	Q12800	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	PHKA1	P46020	1223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GUL7	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ADORA1	P30542	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNB3	P54284	484 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	INHBE	P58166	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB22	O15209	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	PRDX5	P30044	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	POLA2	Q14181	598 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR25	O00155	361 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A1	P11836	297 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	RLBP1	P12271	317 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIFC3-231	ENST00000567479	TCP10	Q12799	353 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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