RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TEKT1Q969V4 418 aa27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRIQ9BWK5 157 aa27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.22■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APBB1O00213 710 aa27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDX5P30044 214 aa27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA5Q8NB90 893 aa27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.21■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCAMP43121 646 aa27.2■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HTRA3P83110 453 aa27.2■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCTPP1Q9H773 170 aa27.19■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.18■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.18■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.18■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CST9Q5W186 159 aa27.17■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PI16Q6UXB8 463 aa27.17■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.17■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCF2Q9UG63 623 aa27.17■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.16■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.16■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDCA5Q96FF9 252 aa27.16■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLRN2A0PK11 232 aa27.15■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLK2Q6UY11 383 aa27.15■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AOX1Q06278 1338 aa27.15■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VEZTQ9HBM0 779 aa27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.14■■□□□ 1.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFAIP1Q13829 316 aa27.13■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.13■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLF2Q8IX21 1173 aa27.13■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.13■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRG1Q96E93 195 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNRKQ9NRH2 765 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.12■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNTNAP1P78357 1384 aa27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAKO14976 1311 aa27.11■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASSF10A6NK89 507 aa27.1■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGSF3O75054 1194 aa27.1■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZAP70P43403 619 aa27.1■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.1■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NF2P35240 595 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MECOMQ03112 1051 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL11AQ9H165 835 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.09■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNNI2P48788 182 aa27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GSTO1P78417 241 aa27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAI14Q9P0K7 980 aa27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP1BP68106 108 aa27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.07■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LDHCP07864 332 aa27.06■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASA3Q14644 834 aa27.06■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.06■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DOCK2Q92608 1830 aa27.05■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.05■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF384Q8TF68 577 aa27.05■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCC1Q96CN9 775 aa27.05■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.04■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM83AQ86UY5 434 aa27.04■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP5JP18859 108 aa27.03■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNB3P54284 484 aa27.03■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HUNKP57058 714 aa27.03■■□□□ 1.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms