RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 CRKP46108 304 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 HTRA3P83110 453 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP48Q86UV5 1035 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPATA5Q8NB90 893 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 DOCK2Q92608 1830 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 AAMPQ13685 434 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAST3O60307 1309 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 SULF1Q8IWU6 871 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 TEKT1Q969V4 418 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCL11AQ9H165 835 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 SNRKQ9NRH2 765 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLRN2A0PK11 232 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCF2Q9UG63 623 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CST9Q5W186 159 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF384Q8TF68 577 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 MRIQ9BWK5 157 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CREBZFQ9NS37 354 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZAP70P43403 619 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYO1BO43795 1136 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDCA5Q96FF9 252 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 MECOMQ03112 1051 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 VEZTQ9HBM0 779 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 GAKO14976 1311 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYH7P12883 1935 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 CACNB3P54284 484 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 CNTNAP1P78357 1384 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 IGHDP01880 384 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 RAI14Q9P0K7 980 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP5JP18859 108 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 GCC1Q96CN9 775 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 FOCADQ5VW36 1801 aa22.64■■□□□ 1.22
USP3-AS1-209ENST00000561191 OTOFQ9HC10 1997 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 RASA3Q14644 834 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 SMC5Q8IY18 1101 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 RASSF10A6NK89 507 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNFAIP1Q13829 316 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLF2Q8IX21 1173 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms