RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAI14Q9P0K7 980 aa21.22■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.22■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGAP02671 866 aa21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 OLFM4Q6UX06 510 aa21.2■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.2■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBD4O95243 580 aa21.2■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNA1SQ13698 1873 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 APPP05067 770 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP7A1P22680 504 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAND2P61296 217 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTFR1LQ9H019 292 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARMT1Q9H993 441 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 JAG2Q9Y219 1238 aa21.19■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLX4Q8IY92 1834 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 E7EWF7 191 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB7AO95365 584 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 LARGE1O95461 756 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF384Q8TF68 577 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMA4Q16363 1823 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 COA1Q9GZY4 146 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAT2P19087 354 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRDX5P30044 214 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 MECOMQ03112 1051 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 LCORLQ8N3X6 602 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALX1Q15699 326 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 EYA3Q99504 573 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYM6O95789 1325 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF213O14771 459 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRKAB2O43741 272 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLD1P28340 1107 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNED1Q8TER0 1413 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD1Q15327 319 aa21.14■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 ME3Q16798 604 aa21.14■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZUG5 572 aa21.14■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.14■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIMBP2O15034 1052 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNA3P22001 575 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKP1Q13835 747 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL6Q8N841 843 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 NECAB1Q8N987 351 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPEP1P16444 411 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUCB2P80303 420 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TGFB2P61812 414 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHST3Q7LGC8 479 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAPBQ9H115 298 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGD1P98174 961 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF3Q9H094 633 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 DTNBO60941 627 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSTO1P78417 241 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST3GAL1Q11201 340 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms