RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	FSCN2	O14926	492 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	GNB5	O14775	395 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ARL4D	P49703	201 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GSTM4	Q03013	218 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	B3GALT4	O96024	378 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CELA3A	P09093	270 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PIP4K2B	P78356	416 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934		F6X3S4	739 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ENC1	O14682	589 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PAGE1	O75459	146 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	NLRP12	P59046	1061 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	RAC1	P63000	192 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	EEA1	Q15075	1411 aa		7	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3R2	O00459	728 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	TM4SF5	O14894	197 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF76	P36508	570 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GRIK4	Q16099	956 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SV2B	Q7L1I2	683 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	WNT8B	Q93098	351 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	COL8A1	P27658	744 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	RNF34	Q969K3	372 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GGT7	Q9UJ14	662 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	DLL1	O00548	723 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM11	O75078	769 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	ECEL1	O95672	775 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	BMP6	P22004	513 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	FANCC	Q00597	558 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	GRIN2B	Q13224	1484 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LINS1-210	ENST00000560934	TCF3	P15923	654 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	NME2	P22392	152 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	MAOB	P27338	520 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	ARNT	P27540	789 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	POU4F3	Q15319	338 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	RELL1	Q8IUW5	271 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	SULF2	Q8IWU5	870 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LINS1-210	ENST00000560934	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.96	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms