RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 CABP4P57796 275 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 RBL2Q08999 1139 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 DPH6Q7L8W6 267 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 ELOA3Q8NG57 546 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 KLF15Q9UIH9 416 aa8.83□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 PAGE1O75459 146 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 NME2P22392 152 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.82□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 APOBRQ0VD83 1088 aa8.81□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.81□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.81□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 LNPKQ9C0E8 428 aa8.81□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.81□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.81□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 GGA1Q9UJY5 639 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.8□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 H3BM21 787 aa8.79□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 H3BRJ5 948 aa8.79□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 AP3B2Q13367 1082 aa8.79□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 KANK3Q6NY19 840 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.78□□□□□ -1
TMOD3-208ENST00000560725 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.78□□□□□ -1
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TMOD3-208ENST00000560725 MPP2Q14168 576 aa8.77□□□□□ -1.01
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TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF11O15085 1522 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 F13A1P00488 732 aa8.76□□□□□ -1.01
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TMOD3-208ENST00000560725 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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TMOD3-208ENST00000560725 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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TMOD3-208ENST00000560725 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.75□□□□□ -1.01
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