RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.66■■□□□ 1.22
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TSPAN3-204ENST00000558394 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.64■■□□□ 1.22
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TSPAN3-204ENST00000558394 CETPP11597 493 aa22.64■■□□□ 1.21
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TSPAN3-204ENST00000558394 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.63■■□□□ 1.21
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TSPAN3-204ENST00000558394 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.61■■□□□ 1.21
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TSPAN3-204ENST00000558394 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.59■■□□□ 1.21
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TSPAN3-204ENST00000558394 RAET1EQ8TD07 263 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPAN3-204ENST00000558394 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.56■■□□□ 1.2
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TSPAN3-204ENST00000558394 BEND3Q5T5X7 828 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSPAN3-204ENST00000558394 SRRDQ9UH36 339 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSPAN3-204ENST00000558394 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 RNF208Q9H0X6 261 aa22.5■■□□□ 1.19
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TSPAN3-204ENST00000558394 CCL5P13501 91 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 OSBPP22059 807 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 AK9Q5TCS8 1911 aa22.49■■□□□ 1.19
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