RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 BMP6P22004 513 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GARTP22102 1010 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SULF2Q8IWU5 870 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PPME1Q9Y570 386 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 NME2P22392 152 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GJA8P48165 433 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 NID1P14543 1247 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 LMNB2Q03252 620 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 MSL1Q68DK7 614 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GPRASP2Q96D09 838 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 DRC1Q96MC2 740 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 RRAGCQ9HB90 399 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 TM4SF5O14894 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 FSCN2O14926 492 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 DGKGP49619 791 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PIP4K2BP78356 416 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GSTM4Q03013 218 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SEPT6Q14141 434 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PDZD3Q86UT5 571 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 CBX8Q9HC52 389 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GREM1O60565 184 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ECEL1O95672 775 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ARNTP27540 789 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 CRKP46108 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ILDR2Q71H61 639 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 GMLQ99445 158 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 UBP1Q9NZI7 540 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SAMM50Q9Y512 469 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-212ENST00000557477 ARID5AQ03989 594 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 AP3B2Q13367 1082 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 SETDB1Q15047 1291 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 WNT8BQ93098 351 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 ARHGEF15O94989 841 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 F13A1P00488 732 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 LMNB1P20700 586 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 FBXO27Q8NI29 283 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 CTSBP07858 339 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 FGRP09769 529 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 ARL4DP49703 201 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-212ENST00000557477 NLRP12P59046 1061 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms