RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557159.5

APEX1-216, Transcript of apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 1, humanhuman

TSL 2

Gene APEX1, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1-216ENST00000557159 CBFA2T2O43439 604 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 DTNBO60941 627 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 NLRP12P59046 1061 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 STK3Q13188 491 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.081e-8■■■□□ 18.5
APEX1-216ENST00000557159 CTR9Q6PD62 1173 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 Q6ZUG5 572 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 TMC6Q7Z403 805 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 MNS1Q8NEH6 495 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 NEDD4P46934 1319 aa14.52□□□□□ -0.08
APEX1-216ENST00000557159 KCNQ2O43526 872 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 YEATS4O95619 227 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TBC1D8O95759 1140 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 NCAPHQ15003 741 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 IFNKQ9P0W0 207 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.52□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 GRM8O00222 908 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ATP5JP18859 108 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 CABP4P57796 275 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TUBB4BP68371 445 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PDIA6Q15084 440 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 AK7Q96M32 723 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.51□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ANXA1P04083 346 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 HOMER1Q86YM7 354 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 RABGGTAQ92696 567 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SDF4Q9BRK5 362 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SMC2O95347 1197 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 CTDNEP1O95476 244 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ME1P48163 572 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 MAP3K9P80192 1104 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PROSER3Q2NL68 480 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PIGBQ92521 554 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 DDX11Q96FC9 970 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.5□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 COL15A1P39059 1388 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ARHGAP6O43182 974 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 RPS6KA5O75582 802 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 EVCP57679 992 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SBF2Q86WG5 1849 aa14.49□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 CCDC151A5D8V7 595 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TRIM37O94972 964 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 CYP21A2P08686 494 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 FANCCQ00597 558 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SLC39A6Q13433 755 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 BRD3Q15059 726 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ZSCAN26Q16670 478 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 ITGB4P16144 1822 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 VGLL3A8MV65 326 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 MAP2K7O14733 419 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 NPHP1O15259 732 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 BRAPQ7Z569 592 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SMARCE1Q969G3 411 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 KAZALD1Q96I82 304 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 YY1AP1Q9H869 796 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.48□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.47□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 SASH3O75995 380 aa14.47□□□□□ -0.09
APEX1-216ENST00000557159 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms