RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 REC8O95072 547 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GTF2IP78347 998 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 LHX8Q68G74 356 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
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CS-220ENST00000550700 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.22□□□□□ -0.61
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CS-220ENST00000550700 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 PDE6AP16499 860 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.615e-10■□□□□ 9.3
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CS-220ENST00000550700 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.21□□□□□ -0.61
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CS-220ENST00000550700 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.21□□□□□ -0.61
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CS-220ENST00000550700 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 CXCL9Q07325 125 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 SLC51AQ86UW1 340 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 GPC2Q8N158 579 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 DPF2Q92785 391 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 TEKT1Q969V4 418 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 SGSM2O43147 1006 aa11.18□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-220ENST00000550700 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-220ENST00000550700 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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