RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 LAMB2P55268 1798 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 DUOX1Q9NRD9 1551 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 BBOX1O75936 387 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 RASAL3Q86YV0 1011 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 GFRA3O60609 400 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 TBC1D8O95759 1140 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 GRAPQ13588 217 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 TAF1P21675 1872 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PTPRCP08575 1304 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CACNA1FO60840 1977 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PSMD14O00487 310 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CASP7P55210 303 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 RPS8P62241 208 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SP8Q8IXZ3 490 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 DPF2Q92785 391 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 GGA3Q9NZ52 723 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 BCAR3O75815 825 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 ALDH1L1O75891 902 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CTSWP56202 376 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SULF1Q8IWU6 871 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CDCA5Q96FF9 252 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 DBNDD1Q9H9R9 158 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 HTTP42858 3142 aa12.15□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 GRM8O00222 908 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 GREM2Q9H772 168 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 PDE4AP27815 886 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 FOXO4P98177 505 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CENPFP49454 3210 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 GPR25O00155 361 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CSF1RP07333 972 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 RPS12P25398 132 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 MAP3K9P80192 1104 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 GPSM2P81274 684 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 PROX2Q3B8N5 592 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 TMC4Q7Z404 712 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 TNNQ9UQP3 1299 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 BRCA2P51587 3418 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 COL4A1P02462 1669 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 RTL9Q8NET4 1388 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ITGA6P23229 1130 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 WASHC4Q2M389 1173 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 MOB2Q70IA6 237 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 SUCLG2Q96I99 432 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 USP44Q9H0E7 712 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 SCN9AQ15858 1988 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 C6orf229H3BNL8 230 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ECE2O60344 883 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 KAZALD1Q96I82 304 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 POLLQ9UGP5 575 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 SZT2Q5T011 3432 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 UBE2Q2LH0YL09 131 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 FKTNO75072 461 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 FKBP1BP68106 108 aa12.09□□□□□ -0.47
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