RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 KRT32Q14532 448 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 IER5LQ5T953 404 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CCDC102BQ68D86 513 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SETDB2Q96T68 719 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 MAST3O60307 1309 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 MYH7P12883 1935 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TULP2O00295 520 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PHKA1P46020 1223 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PI16Q6UXB8 463 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 KIF3AQ9Y496 699 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 COL4A1P02462 1669 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 M0R2C6 588 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 APPP05067 770 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 RPS6KB1P23443 525 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 RXRBP28702 533 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 APPBP2Q92624 585 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 OSBP2Q969R2 916 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GUL6 1792 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 RFC4P35249 363 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CHRNDQ07001 517 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PKP1Q13835 747 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ANKRD1Q15327 319 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 WASHC4Q2M389 1173 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SNAP23O00161 211 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CYP21A2P08686 494 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ADD2P35612 726 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 IFNL1Q8IU54 200 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TIGD1Q96MW7 591 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 NLRP3Q96P20 1036 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 NEK1Q96PY6 1258 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 FEZ1Q99689 392 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 DOCK2Q92608 1830 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CLSTN1O94985 981 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 LARGE1O95461 756 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 RASGRF1Q13972 1273 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 UBE3CQ15386 1083 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SPATA5Q8NB90 893 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TAF1P21675 1872 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 GPAA1O43292 621 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 TRIM37O94972 964 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 BRD1O95696 1058 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 POTEJP0CG39 1038 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 BCAMP50895 628 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-204ENST00000546621 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
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