RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 TRAK2O60296 914 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PSMA5P28066 241 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GYG1P46976 350 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 KRT32Q14532 448 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GSE1Q14687 1217 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 MMP10P09238 476 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SYT1P21579 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 ALX1Q15699 326 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 MTMR6Q9Y217 621 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 FSD2A1L4K1 749 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 CTDNEP1O95476 244 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 KCNJ4P48050 445 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GRAPQ13588 217 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 Q6ZUG5 572 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GTF3C6Q969F1 213 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SLX4Q8IY92 1834 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GJB2P29033 226 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 WASHC4Q2M389 1173 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GBP4Q96PP9 640 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 FOCADQ5VW36 1801 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SMIM22K7EJ46 135 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PFKFB2O60825 505 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PDE6BP35913 854 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 HAND2P61296 217 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 SCRN1Q12765 414 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 TMC4Q7Z404 712 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 LCORLQ8N3X6 602 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 GPT2Q8TD30 523 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 BRF1Q92994 677 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-203ENST00000546585 PRKAB2O43741 272 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 STX6O43752 255 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 JAK2O60674 1132 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 BBOX1O75936 387 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SRGNP10124 158 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ANKRD1Q15327 319 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NEDD4P46934 1319 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SEMA3EO15041 775 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MBD4O95243 580 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 F13A1P00488 732 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MSL1Q68DK7 614 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MCTP1Q6DN14 999 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CHST3Q7LGC8 479 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ARMT1Q9H993 441 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SENP2Q9HC62 589 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 INCENPQ9NQS7 918 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SNED1Q8TER0 1413 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NPR1P16066 1061 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ALDH1B1P30837 517 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 APOBRQ0VD83 1088 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MAP3K12Q12852 859 aa8.19□□□□□ -1.1
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