RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT10BO00744 389 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GYG1P46976 350 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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CLSTN3-215ENST00000544584 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF1P21675 1872 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 COL4A5P29400 1685 aa6.9□□□□□ -1.3
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CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 SPDYE6P0CI01 402 aa6.89□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 PDE3AQ14432 1141 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SHTN1A0MZ66 631 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 PLCG2P16885 1265 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF6Q15052 776 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC102BQ68D86 513 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SSH3Q8TE77 659 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 CSADQ9Y600 493 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMA3Q16787 3333 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 SPEF2Q9C093 1822 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEFA5A3E0 1075 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB11FIP3O75154 756 aa6.86□□□□□ -1.31
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