RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 PHKA1P46020 1223 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 RGMBQ6NW40 437 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 CCDC102AQ96A19 550 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 COG6Q9Y2V7 657 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.45■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ADORA1P30542 326 aa28.44■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 TNFAIP1Q13829 316 aa28.43■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 PDE3AQ14432 1141 aa28.43■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.43■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ZBTB22O15209 634 aa28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 GRIK5Q16478 980 aa28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 CEP85Q6P2H3 762 aa28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 NOGQ13253 232 aa28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 GPR108Q9NPR9 543 aa28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 WBP1LQ9NX94 342 aa28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 PCNTO95613 3336 aa28.41■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 AOC2O75106 756 aa28.39■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 TNNI2P48788 182 aa28.39■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ME3-210ENST00000532471 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.39■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.38■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.38■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.38■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.37■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 HMMRO75330 724 aa28.37■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 RASA3Q14644 834 aa28.37■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.36■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 RASGRF1Q13972 1273 aa28.36■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.36■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.36■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 PRKG1Q13976 671 aa28.35■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 TNNI3KQ59H18 835 aa28.35■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 SLF2Q8IX21 1173 aa28.35■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 ABCF2Q9UG63 623 aa28.35■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.35■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 PRDX5P30044 214 aa28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 MOB2Q70IA6 237 aa28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 AOX1Q06278 1338 aa28.34■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.33■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ME3-210ENST00000532471 FOXN1O15353 648 aa28.32■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.32■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 SPATA5Q8NB90 893 aa28.32■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.32■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 SLC10A3P09131 477 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.31■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 CA12O43570 354 aa28.3■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.3■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.29■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.29■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.29■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 UNCXA6NJT0 531 aa28.28■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 FAM83AQ86UY5 434 aa28.28■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.28■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 HOOK2Q96ED9 719 aa28.28■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 CACNB3P54284 484 aa28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 MAP3K11Q16584 847 aa28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 USP40Q9NVE5 1235 aa28.27■■■□□ 2.12
ME3-210ENST00000532471 LDHCP07864 332 aa28.26■■■□□ 2.11
ME3-210ENST00000532471 GSTO1P78417 241 aa28.26■■■□□ 2.11
ME3-210ENST00000532471 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.26■■■□□ 2.11
ME3-210ENST00000532471 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.26■■■□□ 2.11
ME3-210ENST00000532471 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms