RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530392.1

TATDN3-210, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene TATDN3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-210ENST00000530392 FERMT3Q86UX7 667 aa6.16□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.16□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.16□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 PDGFRBP09619 1106 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 GINM1Q9NU53 330 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.15□□□□□ -1.42
TATDN3-210ENST00000530392 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 F6X3S4 739 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CDK2AP1O14519 115 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PRC1O43663 620 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PHACTR2O75167 634 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 COL8A1P27658 744 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CNGA1P29973 690 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 NOS2P35228 1153 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 GYS2P54840 703 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 MTFR1Q15390 333 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 DNAJC7Q99615 494 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 BCO2Q9BYV7 579 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TIAM1Q13009 1591 aa6.14□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ESYT3A0FGR9 886 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 EML1O00423 815 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 KLF4O43474 513 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 GSTT1P30711 240 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 AMPD3Q01432 767 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TNNI3KQ59H18 835 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SMC5Q8IY18 1101 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.13□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 MEN1O00255 615 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TNFRSF21O75509 655 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 GPC1P35052 558 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 MAP2K3P46734 347 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 POU4F2Q12837 409 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 BIRC2Q13490 618 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 RASA3Q14644 834 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TEAD4Q15561 434 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 MAP3K11Q16584 847 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PMM1Q92871 262 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 NPHS2Q9NP85 383 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 ST7Q9NRC1 585 aa6.12□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CD109Q6YHK3 1445 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 TRIM37O94972 964 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 HIF1AQ16665 826 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CNKSR1Q969H4 720 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 CRBNQ96SW2 442 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 FEZ1Q99689 392 aa6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TATDN3-210ENST00000530392 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms