RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.59□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 H3BRB1 525 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 GSC2O15499 205 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CDC27P30260 824 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 SSTR4P31391 388 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ZAP70P43403 619 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 HELQQ8TDG4 1101 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.58□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC1P33527 1531 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 TM4SF5O14894 197 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KIF4AO95239 1232 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 WISP1O95388 367 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV1-40P01703 118 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CD97P48960 835 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CEP41Q9BYV8 373 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 STOML1Q9UBI4 398 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR7Q9Y216 660 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MROH2AA6NES4 1674 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MADDQ8WXG6 1647 aa6.57□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MPSTP25325 297 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MCTP1Q6DN14 999 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ACAD11Q709F0 780 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 GPR152Q8TDT2 470 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 STIM2Q9P246 746 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.56□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K1Q13233 1512 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 UVSSAQ2YD98 709 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ATCAYQ86WG3 371 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ABTB2Q8N961 1025 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 PBX4Q9BYU1 374 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.55□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 NPATQ14207 1427 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CEP162Q5TB80 1403 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FSCN2O14926 492 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FZD6O60353 706 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 COBLO75128 1261 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 RAPGEF3O95398 923 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 IGHA2P01877 340 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CDC25BP30305 580 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CEP120Q8N960 986 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF428Q96B54 188 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.54□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 TGFB1P01137 390 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 EPHA1P21709 976 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC27Q2M243 656 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM19Q9H013 955 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.53□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.52□□□□□ -1.36
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 MED26O95402 600 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRAP18433 802 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 NFIAQ12857 509 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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