RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516454.1

RNU6-659P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 659, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-659P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-659P-201ENST00000516454 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 MYO19Q96H55 970 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 KCNK12Q9HB15 430 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 CD320Q9NPF0 282 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ADH5P11766 374 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 DYMQ7RTS9 669 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SUV39H1O43463 412 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRPA1O75762 1119 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ACPPP15309 386 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 AFMP43652 599 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 NFKB2Q00653 900 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 IKBKEQ14164 716 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 NFIXQ14938 502 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ACSS3Q9H6R3 686 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SOX13Q9UN79 622 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 CTNND2Q9UQB3 1225 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 U3KQE9 123 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 A6NJR5 290 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 IGHA2P01877 340 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 BORCS6Q96GS4 357 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 KIRREL1Q96J84 757 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 NFKBIEO00221 500 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATP9BO43861 1147 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM87AP0C7U9 286 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ASPAP45381 313 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 LINC00310P59036 64 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 GSTM4Q03013 218 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 HHIPQ96QV1 700 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-659P-201ENST00000516454 FOXO3O43524 673 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ADRB1P08588 477 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZP2Q05996 745 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CDK5R2Q13319 367 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 IKZF1Q13422 519 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 COX20Q5RI15 118 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 OVOL3O00110 214 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CEACAM5P06731 702 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 MED14OSP0DP75 135 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 DPYDQ12882 1025 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 VN1R5Q7Z5H4 357 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 RAD18Q9NS91 495 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 DZANK1Q9NVP4 752 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLAGL2Q9UPG8 496 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ITIH2P19823 946 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 GLDCP23378 1020 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 NEUROD2Q15784 382 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CYFIP1Q7L576 1253 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 BSNDQ8WZ55 320 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 KCNN1Q92952 543 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 KCNC2Q96PR1 638 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 UCN2Q96RP3 112 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 EPB41L4BQ9H329 900 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CELA3BP08861 270 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 BRD2P25440 801 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 WEE1P30291 646 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 OXCT1P55809 520 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM26DQ5JW98 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CXorf38Q8TB03 319 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM13BQ9NYF5 915 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CNTN3Q9P232 1028 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 CTSBP07858 339 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 GPR152Q8TDT2 470 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 ASB11Q8WXH4 323 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 LEFTY1O75610 366 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-659P-201ENST00000516454 INSRRP14616 1297 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms