RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	OIP5	O43482	229 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM129B	Q96TA1	746 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MDFI	Q99750	246 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MMP20	O60882	483 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	EPX	P11678	715 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MAPK1	P28482	360 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PCSK7	Q16549	785 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	NAIP	Q13075	1403 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552		A6NHS1	94 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PSAP	P07602	524 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SOX18	P35713	384 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ATF3	P18847	181 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	NRL	P54845	237 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TMC1	Q8TDI8	760 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	LRP6	O75581	1613 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ALAS2	P22557	587 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ADH7	P40394	386 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	GPLD1	P80108	840 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	PLAUR	Q03405	335 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	MST1R	Q04912	1400 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMC1	P11047	1609 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF1B	O60333	1816 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHA2	P01877	340 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	NEFL	P07196	543 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PDE4D-222	ENST00000514552	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	BRINP3	Q76B58	766 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	PMEPA1	Q969W9	287 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR182	O15218	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ITGAE	P38570	1179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	MET	P08581	1390 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	PHACTR2	O75167	634 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CES1	P23141	567 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	HYAL2	Q12891	473 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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