RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 MRIQ9BWK5 157 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CLRN2A0PK11 232 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 TNFAIP1Q13829 316 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 AIDAQ96BJ3 306 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR108Q9NPR9 543 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB22O15209 634 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TNNI2P48788 182 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 RGMBQ6NW40 437 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC102AQ96A19 550 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP2K2P36507 400 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIK5Q16478 980 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TNNI3KQ59H18 835 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 SLF2Q8IX21 1173 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCF2Q9UG63 623 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 NOGQ13253 232 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 RASGRF1Q13972 1273 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 RASA3Q14644 834 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-210ENST00000505941 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDX5P30044 214 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKG1Q13976 671 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA5Q8NB90 893 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 AOC2O75106 756 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 WBP1LQ9NX94 342 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 AOX1Q06278 1338 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB11FIP3O75154 756 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 GSTO1P78417 241 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 MOB2Q70IA6 237 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 HOOK2Q96ED9 719 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 RAI14Q9P0K7 980 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-210ENST00000505941 APBB1O00213 710 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 LDHCP07864 332 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC10A3P09131 477 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM83AQ86UY5 434 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 AACSQ86V21 672 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 USP40Q9NVE5 1235 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 MCAMP43121 646 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNB3P54284 484 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-210ENST00000505941 PCNTO95613 3336 aa25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.3 ms