RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 MCAMP43121 646 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.718e-8■■■■■ 27.8
PKP4-216ENST00000495123 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CFAP100Q494V2 611 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 GGA3Q9NZ52 723 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 MYH13Q9UKX3 1938 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 PASKQ96RG2 1323 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TRAF5O00463 557 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 PRDX5P30044 214 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 DLK2Q6UY11 383 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.62□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ADM5C9JUS6 153 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 HSPA6P17066 643 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CRKP46108 304 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 MMP14P50281 582 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 AAMPQ13685 434 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 DLGAP5Q15398 846 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 USP48Q86UV5 1035 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SPATA5Q8NB90 893 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SNRKQ9NRH2 765 aa10.61□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CLRN2A0PK11 232 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 IGHDP01880 384 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 HTRA3P83110 453 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 KRT26Q7Z3Y9 468 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ABCF2Q9UG63 623 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.6□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ZAP70P43403 619 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 APLP1P51693 650 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 TEKT1Q969V4 418 aa10.59□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 MAST3O60307 1309 aa10.58□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.58□□□□□ -0.71
PKP4-216ENST00000495123 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 SULF1Q8IWU6 871 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ZNF384Q8TF68 577 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 MRIQ9BWK5 157 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 PITPNM1O00562 1244 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 MYO1BO43795 1136 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 MECOMQ03112 1051 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 CST9Q5W186 159 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 GCC1Q96CN9 775 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 VEZTQ9HBM0 779 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.57□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 CACNB3P54284 484 aa10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 SMC5Q8IY18 1101 aa10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PKP4-216ENST00000495123 CDCA5Q96FF9 252 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms