RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 NPHP1O15259 732 aa19.71■□□□□ 0.75
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TOM1-216ENST00000492723 ANTXR2P58335 489 aa19.71■□□□□ 0.75
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.71■□□□□ 0.75
TOM1-216ENST00000492723 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
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TOM1-216ENST00000492723 SBF2Q86WG5 1849 aa19.7■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF804BA4D1E1 1349 aa19.7■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.69■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.69■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.66■□□□□ 0.74
TOM1-216ENST00000492723 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa19.66■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
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TOM1-216ENST00000492723 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 CTDSPL2Q05D32 466 aa19.64■□□□□ 0.73
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TOM1-216ENST00000492723 SPATA32Q96LK8 384 aa19.64■□□□□ 0.73
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TOM1-216ENST00000492723 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 ADRA2BP18089 450 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 TMEM87BQ96K49 555 aa19.61■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 KDM4AO75164 1064 aa19.6■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 RNF214Q8ND24 703 aa19.6■□□□□ 0.73
TOM1-216ENST00000492723 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
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