RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 GRAPQ13588 217 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CRY2Q49AN0 593 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 PRC1O43663 620 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 JAK2O60674 1132 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 DTNBO60941 627 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 ARMT1Q9H993 441 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CTDNEP1O95476 244 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 KLRK1P26718 216 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 ZNF445P59923 1031 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 TXNRD1Q16881 649 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 LCORLQ8N3X6 602 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CHST3Q7LGC8 479 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 USP48Q86UV5 1035 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 APPP05067 770 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 PLSCR1O15162 318 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 SERPINB2P05120 415 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CYP7A1P22680 504 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 VPS37DQ86XT2 251 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 EP400Q96L91 3159 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 ZNF384Q8TF68 577 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 NAPBQ9H115 298 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 NPHP1O15259 732 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 IGSF3O75054 1194 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 DDR1Q08345 913 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 TRDNQ13061 729 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-211ENST00000492185 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 PRKAB2O43741 272 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 MRE11P49959 708 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 ST5P78524 1137 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 FBXO41Q8TF61 875 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 RAI14Q9P0K7 980 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 ABCF2Q9UG63 623 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 NEDD4P46934 1319 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 XDHP47989 1333 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 AKT1S1Q96B36 256 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 TMEM87BQ96K49 555 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 KIF3AQ9Y496 699 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 LTBP1Q14766 1721 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-211ENST00000492185 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms