RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CEP120	Q8N960	986 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	GJB6	O95452	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM27	P14373	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	NKD1	Q969G9	470 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNA6	P17658	529 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CAP2	P40123	477 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM32	Q13049	653 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PF4	P02776	101 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PCSK2	P16519	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	EREG	O14944	169 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FXN	Q16595	210 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	GPR39	O43194	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ACR	P10323	421 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TYRO3	Q06418	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ARAF	P10398	606 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	RALBP1	Q15311	655 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FGFR1	P11362	822 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76	7e-8	■■□□□ 12.3
UBXN4-208	ENST00000490163	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76	4e-6	■■■■□ 26.2
UBXN4-208	ENST00000490163	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	B3GALT4	O96024	378 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CLC	Q05315	142 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	CCNF	P41002	786 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	WNT2B	Q93097	391 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVK-21	P61565	698 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
UBXN4-208	ENST00000490163	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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