RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 USP48Q86UV5 1035 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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CCL20-204ENST00000489160 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.95□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.93□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 PF4P02776 101 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 SELPP16109 830 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 POU4F3Q15319 338 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 RASIP1Q5U651 963 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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