RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	VGLL4	Q14135	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CCL15	Q16663	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	CACNB3	P54284	484 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	GNAI1	P63096	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRM2-208	ENST00000487591	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	KCNJ4	P48050	445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	GYG1	P46976	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	IRF6	O14896	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	PLIN1	O60240	522 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	TLR2	O60603	784 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591		F6X3S4	739 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DLL1	O00548	723 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	MYO1B	O43795	1136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	CRK	P46108	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	GTF2A2	P52657	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	FLII	Q13045	1269 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	MOGS	Q13724	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	OSBP	P22059	807 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	DPF3	Q92784	378 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	INPP5B	P32019	993 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RRM2-208	ENST00000487591	MGAM	O43451	1857 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	CCL5	P13501	91 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	PSMC4	P43686	418 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	GJB1	P08034	283 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	SLURP2	P0DP57	97 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	CETP	P11597	493 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	GJA8	P48165	433 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RRM2-208	ENST00000487591	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64

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