RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 PI16Q6UXB8 463 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SPATA5Q8NB90 893 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 PRDX5P30044 214 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CRKP46108 304 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 ADM5C9JUS6 153 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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PTPRN-216ENST00000486480 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 USP48Q86UV5 1035 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SULF1Q8IWU6 871 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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PTPRN-216ENST00000486480 TEKT1Q969V4 418 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 BCL11AQ9H165 835 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 AOX1Q06278 1338 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 ABCF2Q9UG63 623 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 DOCK2Q92608 1830 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 MYO1BO43795 1136 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 MRIQ9BWK5 157 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 SNRKQ9NRH2 765 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 CLRN2A0PK11 232 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 DLK2Q6UY11 383 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 HTRA3P83110 453 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 CREBZFQ9NS37 354 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 ZAP70P43403 619 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-216ENST00000486480 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 CST9Q5W186 159 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 CDCA5Q96FF9 252 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 VEZTQ9HBM0 779 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 MECOMQ03112 1051 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 GCC1Q96CN9 775 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 RAI14Q9P0K7 980 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 GAKO14976 1311 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 SLF2Q8IX21 1173 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF384Q8TF68 577 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 TNFAIP1Q13829 316 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 MYH7P12883 1935 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 IGHDP01880 384 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 ATP5JP18859 108 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 CACNB3P54284 484 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 GSTO1P78417 241 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-216ENST00000486480 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.33■■□□□ 1.33
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PTPRN-216ENST00000486480 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.32■■□□□ 1.32
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PTPRN-216ENST00000486480 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 SMC5Q8IY18 1101 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 IGSF3O75054 1194 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 LDHCP07864 332 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 BTDP43251 543 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 GPATCH3Q96I76 525 aa23.31■■□□□ 1.32
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