RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 LRRC24Q50LG9 513 aa29.38■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 OTOFQ9HC10 1997 aa29.38■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 CENPFP49454 3210 aa29.37■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 TNFAIP1Q13829 316 aa29.37■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.37■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 CRKP46108 304 aa29.36■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.36■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 CAP1Q01518 475 aa29.35■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 CRHR2Q13324 411 aa29.34■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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NBPF3-211ENST00000485941 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.33■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 USP44Q9H0E7 712 aa29.33■■■□□ 2.29
NBPF3-211ENST00000485941 OPTNQ96CV9 577 aa29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 MRIQ9BWK5 157 aa29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 ELP3Q9H9T3 547 aa29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM17Q9Y577 477 aa29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 PTPRCP08575 1304 aa29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 FGFR2P21802 821 aa29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 BRCA2P51587 3418 aa29.31■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.3■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.3■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
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NBPF3-211ENST00000485941 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.29■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.29■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.29■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 KIF16BQ96L93 1317 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 BCAMP50895 628 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 MAP3K9P80192 1104 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 VGLL4Q14135 290 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 ERO1AQ96HE7 468 aa29.27■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.27■■■□□ 2.28
NBPF3-211ENST00000485941 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.26■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 TNNI2P48788 182 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 CACNB3P54284 484 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 SP3Q02447 781 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 VPS37DQ86XT2 251 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.25■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 POTEFA5A3E0 1075 aa29.24■■■□□ 2.27
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NBPF3-211ENST00000485941 TEKT1Q969V4 418 aa29.24■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 ARMC5Q96C12 935 aa29.24■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 E9PSI1 815 aa29.23■■■□□ 2.27
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NBPF3-211ENST00000485941 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.23■■■□□ 2.27
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NBPF3-211ENST00000485941 EFCC1Q9HA90 598 aa29.22■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 GTF2A2P52657 109 aa29.21■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.21■■■□□ 2.27
NBPF3-211ENST00000485941 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.21■■■□□ 2.27
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NBPF3-211ENST00000485941 CCL15Q16663 113 aa29.2■■■□□ 2.26
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NBPF3-211ENST00000485941 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.19■■■□□ 2.26
NBPF3-211ENST00000485941 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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NBPF3-211ENST00000485941 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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NBPF3-211ENST00000485941 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.15■■■□□ 2.26
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NBPF3-211ENST00000485941 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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NBPF3-211ENST00000485941 ZBTB22O15209 634 aa29.13■■■□□ 2.25
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NBPF3-211ENST00000485941 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.13■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.13■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 FBXO3Q9UK99 471 aa29.13■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 TLR2O60603 784 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 CETPP11597 493 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 SLC5A1P13866 664 aa29.12■■■□□ 2.25
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