RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 GCC1Q96CN9 775 aa22.16■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.16■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CRKP46108 304 aa22.15■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 APLP1P51693 650 aa22.15■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TEKT1Q969V4 418 aa22.15■■□□□ 1.14
CNKSR1-208ENST00000484874 MYO1BO43795 1136 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 PRDX5P30044 214 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 GGA3Q9NZ52 723 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 USP48Q86UV5 1035 aa22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SULF1Q8IWU6 871 aa22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ABCF2Q9UG63 623 aa22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 PI16Q6UXB8 463 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SLF2Q8IX21 1173 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.11■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.11■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ATP5JP18859 108 aa22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ZAP70P43403 619 aa22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SMC5Q8IY18 1101 aa22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SNRKQ9NRH2 765 aa22.1■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 TRAF5O00463 557 aa22.09■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 IGHDP01880 384 aa22.09■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.09■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.09■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.09■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 LDHCP07864 332 aa22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 GSTO1P78417 241 aa22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 CST9Q5W186 159 aa22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 CREBZFQ9NS37 354 aa22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CNKSR1-208ENST00000484874 GAKO14976 1311 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 MECOMQ03112 1051 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ADM5C9JUS6 153 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF384Q8TF68 577 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 AOX1Q06278 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 CLRN2A0PK11 232 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TNFAIP1Q13829 316 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 GPATCH3Q96I76 525 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 BCL11AQ9H165 835 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 RAI14Q9P0K7 980 aa22.05■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 HAUS7Q99871 368 aa22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 DLK2Q6UY11 383 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 CDCA5Q96FF9 252 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TNNI2P48788 182 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 MAP3K12Q12852 859 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM83AQ86UY5 434 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 VEZTQ9HBM0 779 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.02■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 RASA3Q14644 834 aa22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 USP40Q9NVE5 1235 aa22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP4CP60510 307 aa22■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 FKBP1BP68106 108 aa22■■□□□ 1.11
CNKSR1-208ENST00000484874 NUCB1Q02818 461 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms