RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDE8B	O95263	885 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	REST	Q13127	1097 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOM1	O60784	492 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APPBP2	Q92624	585 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH3	P11055	1940 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AP5Z1	O43299	807 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RXRA	P19793	462 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NR1I2	O75469	434 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRC1	O43663	620 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANTXR2	P58335	489 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADD2	P35612	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COL4A1	P02462	1669 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A087WWV3	80 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF213	O14771	459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCAM	P50895	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADCY5	O95622	1261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDE6A	P16499	860 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH7	P12883	1935 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAF1	P21675	1872 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELP1	O95163	1332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	2e-6	■□□□□ 11.3
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRKAB2	O43741	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGFR2	P21802	821 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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