RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476360.1

XRCC5-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 5, human

TSL 2

Gene XRCC5, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC5-208	ENST00000476360	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.19	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CRHR2	Q13324	411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	COL6A3	P12111	3177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	TAF5L	O75529	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ITGA6	P23229	1130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	FOXO4	P98177	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CHRND	Q07001	517 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	GCKR	Q14397	625 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ABCB7	O75027	752 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	IL1R1	P14778	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	MMP14	P50281	582 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	GRIK5	Q16478	980 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	INHBE	P58166	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
XRCC5-208	ENST00000476360		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	NF2	P35240	595 aa		11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	NUCB1	Q02818	461 aa		11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	RASA3	Q14644	834 aa		11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	CTGF	P29279	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	SP3	Q02447	781 aa		11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360		H0YGN5	161 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	FLII	Q13045	1269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	VGLL4	Q14135	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.1	□□□□□ -0.63
XRCC5-208	ENST00000476360	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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