RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 UNCXA6NJT0 531 aa24.16■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 BCAMP50895 628 aa24.16■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.16■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.15■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 GJA5P36382 358 aa24.14■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.14■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.14■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TNNI2P48788 182 aa24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TEPSINQ96N21 525 aa24.12■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 ELP3Q9H9T3 547 aa24.12■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TEKT1Q969V4 418 aa24.11■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 EYA2O00167 538 aa24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 FGFR2P21802 821 aa24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 CACNB3P54284 484 aa24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 OPTNQ96CV9 577 aa24.1■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 SLC5A1P13866 664 aa24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K9P80192 1104 aa24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM17Q9Y577 477 aa24.08■■□□□ 1.45
SHQ1-206ENST00000471526 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 LPIN2Q92539 896 aa24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 PTPN18Q99952 460 aa24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 MRIQ9BWK5 157 aa24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.07■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CRHR2Q13324 411 aa24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 SIL1Q9H173 461 aa24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 KIF16BQ96L93 1317 aa24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 VGLL4Q14135 290 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CSADQ9Y600 493 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 MAST3O60307 1309 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.03■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.03■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 OTUD5Q96G74 571 aa24.03■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 ERO1AQ96HE7 468 aa24.03■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.03■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.02■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SHQ1-206ENST00000471526 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 GTF2A2P52657 109 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 CCL15Q16663 113 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 ATP2B3Q16720 1220 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 FAM83AQ86UY5 434 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 SP3Q02447 781 aa24■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 WRNIP1Q96S55 665 aa24■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO3Q9UK99 471 aa24■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 CIAO1O76071 339 aa23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 HOOK2Q96ED9 719 aa23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 EFCC1Q9HA90 598 aa23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.99■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.98■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.98■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.98■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.98■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 PRDX5P30044 214 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 TCP10Q12799 353 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 DCAF15Q66K64 600 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 MEIS3Q99687 375 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.97■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 PHKA1P46020 1223 aa23.96■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 ERO1BQ86YB8 467 aa23.96■■□□□ 1.43
SHQ1-206ENST00000471526 SLC34A2O95436 690 aa23.95■■□□□ 1.42
SHQ1-206ENST00000471526 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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