RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.16■■□□□ 1.94
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TTC28-204ENST00000468807 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.15■■□□□ 1.94
TTC28-204ENST00000468807 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.14■■□□□ 1.94
TTC28-204ENST00000468807 SREBF2Q12772 1141 aa27.14■■□□□ 1.94
TTC28-204ENST00000468807 MIER1Q8N108 512 aa27.14■■□□□ 1.94
TTC28-204ENST00000468807 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.14■■□□□ 1.94
TTC28-204ENST00000468807 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.14■■□□□ 1.94
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TTC28-204ENST00000468807 TBC1D8O95759 1140 aa27.13■■□□□ 1.93
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TTC28-204ENST00000468807 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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TTC28-204ENST00000468807 BCAR3O75815 825 aa27.11■■□□□ 1.93
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TTC28-204ENST00000468807 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
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TTC28-204ENST00000468807 LAMB1P07942 1786 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC28-204ENST00000468807 TCP10Q12799 353 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC28-204ENST00000468807 RASGRF1Q13972 1273 aa26.95■■□□□ 1.9
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