RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.71□□□□□ -0.69
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SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP1-204ENST00000459646 WNK4Q96J92 1243 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP1-204ENST00000459646 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.71□□□□□ -0.69
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SH3BP1-204ENST00000459646 TIMM10P62072 90 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 GORABQ5T7V8 394 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 MEIS3Q99687 375 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 MRIQ9BWK5 157 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.63□□□□□ -0.71
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