RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 FAM89AQ96GI7 184 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 EFCC1Q9HA90 598 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 SPRYD7Q5W111 196 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 SP3Q02447 781 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 KIF22Q14807 665 aa6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 ZNF428Q96B54 188 aa6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 H0YGN5 161 aa6.65□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 ARMC5Q96C12 935 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.65□□□□□ -1.34
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CBX1-204ENST00000444685 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-204ENST00000444685 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-204ENST00000444685 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-204ENST00000444685 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ZNF333Q96JL9 665 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 COA1Q9GZY4 146 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-204ENST00000444685 TAF1P21675 1872 aa6.62□□□□□ -1.35
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