RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

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Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 GRIK5Q16478 980 aa25.06■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.06■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 LRRC24Q50LG9 513 aa25.05■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.05■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPRCP08575 1304 aa25.05■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 METTL24Q5JXM2 366 aa25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 VPS37DQ86XT2 251 aa25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPN18Q99952 460 aa25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 PDE8BO95263 885 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 CRHR2Q13324 411 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 ELP3Q9H9T3 547 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM17Q9Y577 477 aa25.02■■□□□ 1.6
GCSHP5-201ENST00000443090 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 OPTNQ96CV9 577 aa25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.01■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 TNNI2P48788 182 aa25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 SSH1Q8WYL5 1049 aa25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 ERO1AQ96HE7 468 aa25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 USP44Q9H0E7 712 aa25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 KIF16BQ96L93 1317 aa25■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.99■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 E9PSI1 815 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 FGFR2P21802 821 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 BCAMP50895 628 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 VGLL4Q14135 290 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 TEKT1Q969V4 418 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 MRIQ9BWK5 157 aa24.98■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP3K9P80192 1104 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.97■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 BRCA2P51587 3418 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.96■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
GCSHP5-201ENST00000443090 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 CACNB3P54284 484 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 CAP1Q01518 475 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 SP3Q02447 781 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 MAST3O60307 1309 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 GTF2A2P52657 109 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 SLFN5Q08AF3 891 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM83AQ86UY5 434 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 CSADQ9Y600 493 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.94■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 CCL15Q16663 113 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 EFCC1Q9HA90 598 aa24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 EYA2O00167 538 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 ARMC5Q96C12 935 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 OTUD5Q96G74 571 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.92■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 POTEFA5A3E0 1075 aa24.9■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.9■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.9■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 LPIN2Q92539 896 aa24.9■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC5A1P13866 664 aa24.89■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 WRNIP1Q96S55 665 aa24.89■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.89■■□□□ 1.58
GCSHP5-201ENST00000443090 ERO1BQ86YB8 467 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 HOOK2Q96ED9 719 aa24.88■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.87■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 CETPP11597 493 aa24.86■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.86■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXO3Q9UK99 471 aa24.86■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 IRF6O14896 467 aa24.85■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 PPIL2Q13356 520 aa24.85■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 DCAF15Q66K64 600 aa24.85■■□□□ 1.57
GCSHP5-201ENST00000443090 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.85■■□□□ 1.57
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