RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PRAME-208ENST00000438888 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PRAME-208ENST00000438888 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PRAME-208ENST00000438888 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-208ENST00000438888 CRBNQ96SW2 442 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-208ENST00000438888 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 UBE4AQ14139 1066 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 IFNL1Q8IU54 200 aa15.51■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 ELP3Q9H9T3 547 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.48■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAME-208ENST00000438888 CRHR2Q13324 411 aa15.46■□□□□ 0.07
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PRAME-208ENST00000438888 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 TEPSINQ96N21 525 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.45■□□□□ 0.06
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PRAME-208ENST00000438888 PDE8BO95263 885 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 AAMPQ13685 434 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
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PRAME-208ENST00000438888 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 TEKT1Q969V4 418 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 OTUD5Q96G74 571 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 ERO1AQ96HE7 468 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.42■□□□□ 0.06
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PRAME-208ENST00000438888 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.42■□□□□ 0.06
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PRAME-208ENST00000438888 HTTP42858 3142 aa15.42■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 MAP3K9P80192 1104 aa15.41■□□□□ 0.06
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PRAME-208ENST00000438888 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 MEIS3Q99687 375 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 USP44Q9H0E7 712 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 EFCC1Q9HA90 598 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.41■□□□□ 0.06
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