RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ABCC12Q96J65 1359 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CAVIN2O95810 425 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CSF1RP07333 972 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CTSWP56202 376 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD1Q15327 319 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 TAF3Q5VWG9 929 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 FERMT3Q86UX7 667 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CNKSR1Q969H4 720 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 EVI5LQ96CN4 794 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 MASTLQ96GX5 879 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 GPATCH3Q96I76 525 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ZNF165P49910 485 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 MTX1Q13505 466 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 MAP4K1Q92918 833 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 FBXO3Q9UK99 471 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 HIP1O00291 1037 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 SRGNP10124 158 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 SNRKQ9NRH2 765 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 SLC27A2O14975 620 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 NEMFO60524 1076 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 KCNJ4P48050 445 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 FOXO4P98177 505 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 SOGA3Q5TF21 947 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CEP135Q66GS9 1140 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 SARM1Q6SZW1 724 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-203ENST00000429751 NR1I2O75469 434 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 BBOX1O75936 387 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 KIF18AQ8NI77 898 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 SUCLG2Q96I99 432 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 PIM2Q9P1W9 311 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 RPS6KB1P23443 525 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 RNF20Q5VTR2 975 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 BICD2Q8TD16 824 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 PGBD1Q96JS3 809 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 IGSF3O75054 1194 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 GRAPQ13588 217 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 TTLL6Q8N841 843 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 CACNA1SQ13698 1873 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 SLFN14P0C7P3 912 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 IQCB1Q15051 598 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 SYNE4Q8N205 404 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 KAZALD1Q96I82 304 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 FAM227BQ96M60 508 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 SYT17Q9BSW7 474 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 DPEP1P16444 411 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-203ENST00000429751 RESTQ13127 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms