RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
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HCLS1-202ENST00000428394 TAF3Q5VWG9 929 aa19.54■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 ANO1Q5XXA6 986 aa19.54■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF15Q8N660 670 aa19.54■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
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HCLS1-202ENST00000428394 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 SLC39A14Q15043 492 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.53■□□□□ 0.72
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HCLS1-202ENST00000428394 NEDD4P46934 1319 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8BA8MQT2 603 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 CBX1P83916 185 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
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HCLS1-202ENST00000428394 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa19.53■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 PHLPP1O60346 1717 aa19.52■□□□□ 0.72
HCLS1-202ENST00000428394 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.52■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF11Q86T75 865 aa19.52■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.52■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 NID2Q14112 1375 aa19.52■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 STK36Q9NRP7 1315 aa19.51■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.51■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF202O95125 648 aa19.51■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 TRDNQ13061 729 aa19.51■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.51■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF213O14771 459 aa19.5■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 MTA3Q9BTC8 594 aa19.5■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 FAM53CQ9NYF3 392 aa19.5■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 CSF1RP07333 972 aa19.49■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GVL5 298 aa19.49■□□□□ 0.71
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HCLS1-202ENST00000428394 TPM1P09493 284 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 UBE3CQ15386 1083 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ALX1Q15699 326 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 DPCR1Q3MIW9 517 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC24Q50LG9 513 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 KRT222Q8N1A0 295 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 WASF1Q92558 559 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 CLIC4Q9Y696 253 aa19.49■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 CUTAO60888 179 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 CHGBP05060 677 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 PFKFB1P16118 471 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 RCAN1P53805 252 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 NCAPHQ15003 741 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 WASHC4Q2M389 1173 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 MYH3P11055 1940 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ECM29Q5VYK3 1845 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 FAM177BA6PVY3 158 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ANTXR2P58335 489 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 MYL5Q02045 173 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 SGMS1Q86VZ5 419 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 LRP5O75197 1615 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 LRP6O75581 1613 aa19.47■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.46■□□□□ 0.71
HCLS1-202ENST00000428394 SMC2O95347 1197 aa19.46■□□□□ 0.71
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