RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD7Q92527 254 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ADORA1P30542 326 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 CERKQ8TCT0 537 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 SMTNL1A8MU46 457 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF592Q92610 1267 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 SDF4Q9BRK5 362 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP10Q86W26 655 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIC4Q9Y696 253 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 USP27XA6NNY8 438 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXP2O15409 715 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CIAO1O76071 339 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 BARGINQ6ZT62 677 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA8P51970 172 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 STK38Q15208 465 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf76Q96K31 380 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PRC1O43663 620 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 SKILP12757 684 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ADALQ6DHV7 355 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 XAGE2Q96GT9 111 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FGAP02671 866 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 SCARF1Q14162 830 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS72Q15906 364 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TICAM2Q86XR7 235 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC69A6NI79 296 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 GREM2Q9H772 168 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP98P52948 1817 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP135Q66GS9 1140 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PI16Q6UXB8 463 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 EVCP57679 992 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NEMFO60524 1076 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ZAP70P43403 619 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 AFF2P51816 1311 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAP23O00161 211 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CPLX1O14810 134 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL16Q8N461 479 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQ27 194 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQ64 194 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQD8 194 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTLC2O15270 562 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ANTXR2P58335 489 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CCZ1BP86790 482 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SPEF2Q9C093 1822 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 BIN1O00499 593 aa21.7■■□□□ 1.06
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