RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANO9A1A5B4 782 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C19orf67A6NJJ6 358 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 APAF1O14727 1248 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SNX2O60749 519 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RFPL1O75677 317 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RHOBTB3O94955 611 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GJB6O95452 261 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EYA4O95677 639 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCSK2P16519 638 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CPEP16870 476 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATICP31939 592 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDIT3P35638 169 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZAP70P43403 619 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RENBPP51606 427 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CASP7P55210 303 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUCB1Q02818 461 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STK3Q13188 491 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FXNQ16595 210 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PTPRNQ16849 979 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPECC1Q5M775 1068 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MSL1Q68DK7 614 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CFAP161Q6P656 301 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RASSF3Q86WH2 238 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USP33Q8TEY7 942 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PGBD4Q96DM1 585 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUDT12Q9BQG2 462 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CSRNP2Q9H175 543 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBRSQ9HAH7 460 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STRN4Q9NRL3 753 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZFATQ9P243 1243 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A6NCN8 305 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A6NHS1 94 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MTA2O94776 668 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ABLIM3O94929 683 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SEC24BO95487 1268 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AGR2O95994 175 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM153BP0C7A2 387 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TYRP1P17643 537 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EPHA4P54764 986 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZBED6P86452 979 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TAF11Q15544 211 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MORN1Q5T089 497 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MZT2AQ6P582 158 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HSCBQ8IWL3 235 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TPH2Q8IWU9 490 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TTC16Q8NEE8 873 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NKD1Q969G9 470 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GJA10Q969M2 543 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM52Q96A61 297 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SERINC2Q96SA4 455 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CARD14Q9BXL6 1004 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IP6K2Q9UHH9 426 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM50BQ9Y247 325 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms