RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT79Q5XKE5 535 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 GPATCH11Q8N954 259 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 MNAT1P51948 309 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 NEK11Q8NG66 645 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC77Q9BR77 488 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 STX17P56962 302 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM13AO94988 1023 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 MCM7P33993 719 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PLCH2O75038 1416 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ASXL2Q76L83 1435 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 SEC24BO95487 1268 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ARID5AQ03989 594 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CNBD1Q8NA66 436 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PICK1Q9NRD5 415 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 NPATQ14207 1427 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 FBF1Q8TES7 1133 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ELP1O95163 1332 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 BACH1O14867 736 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 A2MP01023 1474 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CAPN2P17655 700 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT24Q2M2I5 525 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 MSL1Q68DK7 614 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 DCAF5Q96JK2 942 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 GJC1P36383 396 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS18Q9P253 973 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 RPS6KB1P23443 525 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CNGA4Q8IV77 575 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 IQUBQ8NA54 791 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 SH2D4AQ9H788 454 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 UFL1O94874 794 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 MYL5Q02045 173 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 NOD1Q9Y239 953 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 NBPF11Q86T75 865 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 GNA11P29992 359 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC14Q96N46 770 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 RXRAP19793 462 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ATP2A1O14983 1001 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 TESK2Q96S53 571 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PP64 1363 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 GCP02774 474 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 TUBBP07437 444 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 MXRA7P84157 204 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1B0GVL5 298 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC6Q16204 474 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC6Q86TZ1 520 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ATP10BO94823 1461 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 VAV2P52735 878 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 ZMYND15Q9H091 742 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD28-201ENST00000399451 OGFRQ9NZT2 677 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms