RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTM4Q03013 218 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 CRELD1Q96HD1 420 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM11O75078 769 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 BACH2Q9BYV9 841 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP44Q9C0F1 390 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ENC1O14682 589 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SELPP16109 830 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP12P59046 1061 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SV2BQ7L1I2 683 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CD163Q86VB7 1156 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf172C9J069 976 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 PAGE1O75459 146 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 WISP1O95388 367 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 RECKO95980 971 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 APBA3O96018 575 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP11A1P05108 521 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNA4P43681 627 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 STK35Q8TDR2 534 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CELA3AP09093 270 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP6P22004 513 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MAOBP27338 520 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 AP3B2Q13367 1082 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 POU4F3Q15319 338 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NACC1Q96RE7 527 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ECEL1O95672 775 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DLGAP3O95886 979 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSBP07858 339 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NME2P22392 152 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ARNTP27540 789 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DOC2BQ14184 412 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZD3Q86UT5 571 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SULF2Q8IWU5 870 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 USP26Q9BXU7 913 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-202ENST00000370826 F8W735 103 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 RASIP1Q5U651 963 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ACAD11Q709F0 780 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 CORO1BQ9BR76 489 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 USP21Q9UK80 565 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 E9PSI1 815 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ALX3O95076 343 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGB7P26010 798 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRE1Q14246 886 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K11Q16584 847 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMM50Q9Y512 469 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 MEGF11A6BM72 1044 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 RLBP1P12271 317 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 LIG3P49916 1009 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FANCCQ00597 558 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 MBTPS1Q14703 1052 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-202ENST00000370826 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.5□□□□□ -1.37
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