RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364025.1

RN7SKP245-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 245, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP245, Length 320 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP245-201ENST00000364025 TBC1D8O95759 1140 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLC5A1P13866 664 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TRIM27P14373 513 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CACNB3P54284 484 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 DGKZQ13574 1117 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIF16BQ96L93 1317 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CIAO1O76071 339 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TM4SF4P48230 202 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 ATP2B3Q16720 1220 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 SPRYD7Q5W111 196 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TEPSINQ96N21 525 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 ADORA1P30542 326 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAP3K11Q16584 847 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 TEKT1Q969V4 418 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 COPRSQ9NQ92 184 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 SRGAP3O43295 1099 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 GNAI3P08754 354 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 PHKA1P46020 1223 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TIMM10P62072 90 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 FBXO3Q9UK99 471 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 GJA5P36382 358 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TNFAIP1Q13829 316 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 MRIQ9BWK5 157 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TFCP2Q12800 502 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 WNK4Q96J92 1243 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 GNAI2P04899 355 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 PRDX5P30044 214 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 TNNI2P48788 182 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 SREBF2Q12772 1141 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 MTX1Q13505 466 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 CCDC102BQ68D86 513 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ELP3Q9H9T3 547 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 A0A1B0GUL7 405 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 UNCXA6NJT0 531 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 GPR25O00155 361 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 IFNL1Q8IU54 200 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAST3O60307 1309 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP245-201ENST00000364025 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 INHBEP58166 350 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAP3K9P80192 1104 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 RASGRF1Q13972 1273 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 OPTNQ96CV9 577 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 XAGE2Q96GT9 111 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 PTPN18Q99952 460 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 SEMA3EO15041 775 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 RLBP1P12271 317 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 TCP10Q12799 353 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 NFIAQ12857 509 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 VGLL4Q14135 290 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 FAM83AQ86UY5 434 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms