RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360325.11

CLDN7-201, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-201ENST00000360325 GTF2IP78347 998 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN7-201ENST00000360325 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN7-201ENST00000360325 BCS1LQ9Y276 419 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN7-201ENST00000360325 ECE2O60344 883 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 NECTIN1Q15223 517 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 GRIK5Q16478 980 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 VPS53Q5VIR6 699 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 VPS33BQ9H267 617 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 PALD1Q9ULE6 856 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ANAPC15P60006 121 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 AIDAQ96BJ3 306 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 IL17RAQ96F46 866 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 FOXP2O15409 715 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 MBD4O95243 580 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 KCNB2Q92953 911 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 FBXW7Q969H0 707 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ARMT1Q9H993 441 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 SCN9AQ15858 1988 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 SLC27A2O14975 620 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 GSTO1P78417 241 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 LCORLQ8N3X6 602 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 NFKBIEO00221 500 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 RASEFQ8IZ41 740 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 CERS5Q8N5B7 392 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 COL4A5P29400 1685 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 USP17L3A6NCW0 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 USP17L4A6NCW7 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 YDJCA8MPS7 323 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 RABEP1Q15276 862 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 RNF20Q5VTR2 975 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-201ENST00000360325 LDHCP07864 332 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 GNAT2P19087 354 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 DACT2Q5SW24 774 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 MXD3Q9BW11 206 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 SYT17Q9BSW7 474 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 PSME4Q14997 1843 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 FGAP02671 866 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 ALX1Q15699 326 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 SLF2Q8IX21 1173 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 PRKAB2O43741 272 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 NIM1KQ8IY84 436 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 GAKO14976 1311 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 ZMYM6O95789 1325 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 APPP05067 770 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 CYP21A2P08686 494 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 PPP4CP60510 307 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 RASSF7Q02833 373 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 F8W031 263 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 BAG3O95817 575 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 SNX21Q969T3 373 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CLDN7-201ENST00000360325 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms