RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 LAMA4Q16363 1823 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 UFL1O94874 794 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NPR1P16066 1061 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 FGD1P98174 961 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 SP8Q8IXZ3 490 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NECAB1Q8N987 351 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ZMYM6O95789 1325 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ST3GAL1Q11201 340 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ZNF384Q8TF68 577 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 BRF1Q92994 677 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NAPBQ9H115 298 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 CACNA1SQ13698 1873 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 PRKAB2O43741 272 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ALDH1B1P30837 517 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 BAG6P46379 1132 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NCOA7Q8NI08 942 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NBPF3Q9H094 633 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 MECOMQ03112 1051 aa22.7■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.7■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 POLLQ9UGP5 575 aa22.7■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 BRD1O95696 1058 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 CHST3Q7LGC8 479 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 MASTLQ96GX5 879 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 JAG2Q9Y219 1238 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 PRDX5P30044 214 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 MCM5P33992 734 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 TRDNQ13061 729 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 STK3Q13188 491 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 FBXL16Q8N461 479 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 CD209Q9NNX6 404 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 C6orf229H3BNL8 230 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 GJB2P29033 226 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 TDO2P48775 406 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 IGSF3O75054 1194 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 IL1R1P14778 569 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 GTF3C6Q969F1 213 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 PRC1O43663 620 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 APOBRQ0VD83 1088 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 LTBP1Q14766 1721 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 SYT1P21579 422 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UPP1-201ENST00000331803 H0YIN7 160 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 DTNBO60941 627 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ANTXR2P58335 489 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 MPNDQ8N594 471 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 STX6O43752 255 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 PFKFB2O60825 505 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 OLFM4Q6UX06 510 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 EVCP57679 992 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-201ENST00000331803 SCRN1Q12765 414 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms