RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ACDQ96AP0 544 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 EPXP11678 715 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 EPHA1P21709 976 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ALAS2P22557 587 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GJA8P48165 433 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PCDH1Q08174 1060 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 RHOVQ96L33 236 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 SPON2Q9BUD6 331 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 B3GALT4O96024 378 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 RLBP1P12271 317 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 CDC25BP30305 580 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GRIK5Q16478 980 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 RASIP1Q5U651 963 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TTC9Q92623 222 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ALBP02768 609 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PF4P02776 101 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GMLQ99445 158 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 BMP6P22004 513 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 CDC27P30260 824 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 HGSNATQ68CP4 663 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 STK35Q8TDR2 534 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GPRASP2Q96D09 838 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 GARTP22102 1010 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 ARID5AQ03989 594 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 IKBKEQ14164 716 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF404-201ENST00000324394 FAM177BA6PVY3 158 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 UBXN4Q92575 508 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 M0R082 166 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 GREM1O60565 184 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 CABP4P57796 275 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 LMNB2Q03252 620 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SULF2Q8IWU5 870 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 UBP1Q9NZI7 540 aa6.51□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 H3BRJ5 948 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 LINC01387J3KSC0 135 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 LILRB5O75023 590 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 ATP2B1P20020 1258 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 NME2P22392 152 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 CHSY3Q70JA7 882 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 VPS37DQ86XT2 251 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 PPME1Q9Y570 386 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 OIP5O43482 229 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 FGRP09769 529 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 CRKP46108 304 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 BTBD6Q96KE9 485 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 CBX8Q9HC52 389 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 SAMM50Q9Y512 469 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF404-201ENST00000324394 F13A1P00488 732 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.5 ms