RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 XAGE2Q96GT9 111 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 FSD2A1L4K1 749 aa18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF2IP78347 998 aa18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 MXD3Q9BW11 206 aa18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF609O15014 1411 aa18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 HIP1O00291 1037 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TNIP1Q15025 636 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 RASEFQ8IZ41 740 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GPC2Q8N158 579 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 USP17L3A6NCW0 530 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 USP17L4A6NCW7 530 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 IL1R1P14778 569 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 PHKA1P46020 1223 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 PTH1RQ03431 593 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GORABQ5T7V8 394 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 RRAGCQ9HB90 399 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC102BQ68D86 513 aa18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR108Q9NPR9 543 aa18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 MCTP1Q6DN14 999 aa18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP5JP18859 108 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNB2Q92953 911 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM227BQ96M60 508 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC14Q96N46 770 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SHTN1A0MZ66 631 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 POTECB2RU33 542 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SCNN1DP51172 638 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 DACT2Q5SW24 774 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 FSD1Q9BTV5 496 aa18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SNRKQ9NRH2 765 aa18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.87■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 EPS15P42566 896 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 NECTIN1Q15223 517 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP4K1Q92918 833 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 PSME4Q14997 1843 aa18.86■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 F8W031 263 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 BRD1O95696 1058 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 AK2P54819 239 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CERS5Q8N5B7 392 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR90Q96KV7 1748 aa18.85■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RASGRF1Q13972 1273 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 PI16Q6UXB8 463 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MICALL2Q8IY33 904 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 HACL1Q9UJ83 578 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0D9SFI3 127 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MRE11P49959 708 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SCARF1Q14162 830 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RUFY3Q7L099 469 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.84■□□□□ 0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms