RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF2CQ99661 725 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2IP78347 998 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 BCS1LQ9Y276 419 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.83■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS53Q5VIR6 699 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ECE2O60344 883 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 NECTIN1Q15223 517 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS33BQ9H267 617 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF384Q8TF68 577 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXW7Q969H0 707 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PALD1Q9ULE6 856 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD4O95243 580 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF20Q5VTR2 975 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN9AQ15858 1988 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 GSTO1P78417 241 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RABEP1Q15276 862 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17RAQ96F46 866 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMT1Q9H993 441 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAT2P19087 354 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC27A2O14975 620 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIK5Q16478 980 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 LCORLQ8N3X6 602 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNB2Q92953 911 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXP2O15409 715 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RASEFQ8IZ41 740 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PSME4Q14997 1843 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L3A6NCW0 530 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L4A6NCW7 530 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LDHCP07864 332 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLF2Q8IX21 1173 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 APPP05067 770 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CERS5Q8N5B7 392 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NFKBIEO00221 500 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 COL4A5P29400 1685 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FGAP02671 866 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYM6O95789 1325 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP21A2P08686 494 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DACT2Q5SW24 774 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NIM1KQ8IY84 436 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 YDJCA8MPS7 323 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 BAG3O95817 575 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 BECN1Q14457 450 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT17Q9BSW7 474 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MXD3Q9BW11 206 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT32Q14532 448 aa24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CERS3Q8IU89 383 aa24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMA4Q16363 1823 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ALX1Q15699 326 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 F8W031 263 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKAB2O43741 272 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ST18O60284 1047 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-201ENST00000298838 IL27Q8NEV9 243 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms