RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.56■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 CACNA1FO60840 1977 aa20.55■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.55■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 CETPP11597 493 aa20.55■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 LINS1Q8NG48 757 aa20.55■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.54■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.54■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 SZT2Q5T011 3432 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 PLIN1O60240 522 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 DPF3Q92784 378 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.52■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 ERO1BQ86YB8 467 aa20.52■□□□□ 0.88
CLEC1B-201ENST00000298527 SNAPC2Q13487 334 aa20.51■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.51■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.51■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 BTBD19C9JJ37 291 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HOXD10P28358 340 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 FOXO4P98177 505 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SHISA4Q96DD7 197 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HOOK2Q96ED9 719 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.5■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CRKP46108 304 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 WWC1Q8IX03 1113 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.49■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 PPIL2Q13356 520 aa20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 UBE4AQ14139 1066 aa20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 MTFR1Q15390 333 aa20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SRRDQ9UH36 339 aa20.48■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 DLL1O00548 723 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 IRF6O14896 467 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 GJA8P48165 433 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC27Q2M243 656 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 C17orf99Q6UX52 265 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 WRNIP1Q96S55 665 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.47■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 F6X3S4 739 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 GJB1P08034 283 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 GRK4P32298 578 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 RAET1EQ8TD07 263 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 PRO3102Q9H379 93 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.46■□□□□ 0.87
CLEC1B-201ENST00000298527 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 PSMC4P43686 418 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 GYG1P46976 350 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 PPATQ06203 517 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 TRIM47Q96LD4 638 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.45■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PPC1 479 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 DCAF15Q66K64 600 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM83AQ86UY5 434 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.44■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 CCL5P13501 91 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 OSBPP22059 807 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 UBXN2AP68543 259 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 BEND3Q5T5X7 828 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 TEKT1Q969V4 418 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 MRIQ9BWK5 157 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF208Q9H0X6 261 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 CPA4Q9UI42 421 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 IL16Q14005 1332 aa20.43■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 CTGFP29279 349 aa20.42■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS37DQ86XT2 251 aa20.42■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 MYPNQ86TC9 1320 aa20.42■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 GRM8O00222 908 aa20.41■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 VAMP4O75379 141 aa20.41■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 CAPN2P17655 700 aa20.41■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.41■□□□□ 0.86
CLEC1B-201ENST00000298527 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms